5毫米口径火炮、两门40毫米口径防空炮、两挺舰载机枪，总计搭载60名乘员。
战争爆发伊始，“雄鹰”号便被部署在格但斯克海峡担负作战任务。9月4日，潜艇空气压缩机的管道系统出现故障，潜艇需要前往瑞典南部哥得兰岛进行维修。但是祸不单行，正在行进中的“雄鹰”号又碰到了一件棘手的事情：潜艇指挥官科洛茨科夫斯基此时得了重病，艇上的医生怀疑艇长得了伤寒，而且会传染给所有人。
10月12日，他们最后决定改道前往爱沙尼亚首都塔林为艇长求医。10月14日晚，他们赶到了塔林，第二天早上艇长被送到了医院，最后被确诊为疲劳过度，而非伤寒。重病中的艇长随后便留在塔林医院中静养，从此再也未能登上他的潜艇。随艇医生的误诊不但影响了这位艇长后来的命运，也为爱沙尼亚招来了大祸……
波兰潜艇到来的消息传到了塔林的德国大使馆，德国大使立即约见塔林官员要求立即扣留“雄鹰”号。这一情报传到“雄鹰”号后，虽然艇长还在医院就诊，但艇员们还是决定立即启航离开塔林，但不巧的是：10月15日白天德国货船“塔拉塔”号刚好从塔林出发前往德国，因此“雄鹰”号无法立即启航逃离。(根据国际法规定，双方交战国船只如果从同一中立国港口出发，那么前后时间间隔不能少于24个小时。)滞留在港内的“雄鹰”号被迫又等了整整一天，最终还是被爱沙尼亚当局扣留了。
时任爱沙尼亚军队总司令的约翰※#拉伊多内将军主持召开了特别会议，商讨如何处置波兰潜艇一事，最后决定拆卸潜艇上的鱼雷、弹药和火炮尾闩，没收艇上的海图及导航设备，所有艇员也要被囚禁在沿岸的兵营内。10月16日，还不放心的爱沙尼亚当局又下令抽取潜艇上的燃油。随后爱沙尼亚的报纸向外界报道了爱沙尼亚扣留波兰潜艇一事。
不过，爱沙尼亚当局采取的保安措施却异常疏忽，潜艇只有两名爱沙尼亚哨兵看守，此外9月17日潜艇停泊的位置也发生了变化，艇头朝向了大海，而爱沙尼亚当局的解释是：这样做是为了港口起重机的作业，方便拆卸艇头剩余的6枚鱼雷。
10月17日国际时局发生了重大变化，苏联已向波兰出兵。波兰和英国驻爱沙尼亚大使馆立即向被拘禁的波兰水兵通报了这一消息，并且号召他们立即逃离爱沙尼亚。“雄鹰”号潜艇副艇长格鲁钦斯基少校决定组织武力行动夺取潜艇，逃离塔林。
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